公司税务异常可能有以下原因：

1、‌报税信息错误‌：如果公司在报税过程中出现报税信息的错误，例如税号、名称等关键信息填写不准确，导致申报数据出现严重失误，税务部门无法正常受理，公司的税务出现异常。

2、长期未记账报税：如果公司长时间未进行记账报税、长时间零申报、存在偷税漏税行为以及发生工商变更未进行相应的税务变更登记等，也可能导致企业税务异常。

如果对税务政策不熟悉，或是对不同税种和税率不够了解，导致报税出现偏差，也会导致申报错误。