公司税务零报税的申报流程如下：

1、登录系统：使用企业税务账号和密码登录税务系统，找到相应的申报功能入口，选择零申报选项。若是线下申报税务的，需前往税务局办税服务厅，准备纳税申报表、财务报表、发票、凭证等相关资料。

2、填写申报表格：零申报表格包括企业基本信息、申报税种等内容。在填写完成后，仔细核对表格信息的准确性和完整性，也要注意是否遗漏或错误的应纳税项目。

3、提交申报表格：确认无误后，点击提交按钮将申报表格提交给税务机关。税务机关将对企业的申报资料进行审核，并核对其准确性。如果发现问题，可能要求企业进行补正。

4、确认申报：系统会生成申报确认，表明申报已成功提交。