公司在进行注册资本变更时，主要涉及的税种包括印花税和企业所得税、增值税等。注册资本增方式影响缴纳的税种和税务的处理方式。

例如公司使用自有资产（如土地、专利）的方式进行增资，那么需要对此进行价值评估，通过评估增值来增加注册资本，那么需要缴纳增值税。如果公司是直接使用现金或资产的方式进行增值，通常是不用另外交税的。