二类医疗器械经营备案主要包括以下几个步骤：

提交申请：申请人需备齐上述资料后，向所在地市场监督管理局）提出申请，并填写第二类医疗器械经营备案表。

材料审查：食品药品监督管理部门会对企业提交的资料进行完整性核对。若申请材料齐全且符合法定形式，将接受备案资料，并可能进一步进行现场核查。

现场核查：按照医疗器械经营质量管理规范要求对第二类医疗器械经营企业开展现场核查。

备案凭证：经过审查或现场核查，若企业符合相关法规要求，食品药品监督管理部门将出具第二类医疗器械经营备案凭证。