公司线上零申报流程如下:

1、登录当地税务部门官网，点击进入税务申报；

2、点击增值税申报，填写增值税报表。 报告书的数据全部填写为零；

3、填写完成后进行数字签名；

4、检查表格，如果没有错误，请点击提交。

申报在税务机关办理税务登记的纳税人、扣缴义务人未发生当期应纳税行为的，应当依照国家税收法律、行政法规和规章的规定向税务机关办理申报手续，并载明无当期应纳税事项。