企业准备好申请材料，向所在地的市级食品药品监督管理部门备案。食品药品监督管理部门会当场对企业提交资料的完整性进行核对，申请材料齐全且符合法定形式，则予以受理。

如果公司申请文件不齐全或不符合要求的，退回材料，申请人进行相关材料的补充。

等待审核符合备案条件后，同时将复核审查结果并作出决定，并发给企业第二类医疗器械经营备案凭证。