企业长期零申报可能给企业带来一系列风险：

企业进行零申报说明其在该纳税期间没有营业收入，如果公司连续三个月或者是在一年之内有六个月都进行零申报的，这种情况属于异常申报，会被列入重点关注。

如果税务机关发现企业存在隐瞒经营收入的不当行为，会要求企业补缴以往应缴纳的税款以及滞纳金，还会对企业进行罚款。

对于长期零申报且持有发票的纳税人，税务机关可能会降低该企业发票的版本和数量。另外，长期零申报可能导致企业信用评级降低。