一、未完成清算程序

公司注销营业执照前要完成资产清算、债务债权清偿等。公司清算组成员应当在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，制定适合企业的清算方案。

二、税务问题

公司在注销前要将税务相关欠款全部缴清，如果存在未缴清情况或者税务违法行为，那么不能完成清税，税务部门不会出具注销所需的完税证明。

三、证照不齐全或遗失

公司注销需要提交清算报告、营业执照、清税证明等资料。如果证照遗失将会导致注销申请被拒绝。若企业出现资料准备不齐全或存在错误的情况。