当企业被税务部门稽查时，应按照通知要求配合并提供相关的财务和税务材料，不得隐瞒或提供虚假信息。企业应确保财务报表真实可靠，准确反映经营状况。同时，完善财务管理制度，规范发票管理和纳税申报流程，避免出现漏报、误报等问题。

如果在稽查过程中，发现企业的确存在违规行为，或出现了税收问题，应立即根据实际情况进行处理，并按照税收要求补缴税款和滞纳金。

企业被税务稽查的原因多种多样，但被核查到并非是企业出现问题，可能只能常规抽查，因此只要企业规范财务管理和纳税申报流程，遇到问题及时处理，就能够有效应对税务稽查。