公司长期零申报可能有什么影响：

公司长期零申报，可能会被税务机关纳入重点监控范围，并进行纳税评估。如发现隐瞒收入、虚开发票等行为，需补缴税款和滞纳金。

公司非正常原因的长期零申报会影响纳税信用等级，可能会被降为D级。

如果存在偷税行为，将会被处以罚款，并需补缴税款和滞纳金，情节严重的还可能被移送稽查。

间接导致注销的因素：

长期零申报且被税务机关认定为走逃户的，会被纳入重大的失信黑名单中并对外公告，这将严重影响公司的信誉和运营。

在此情况下，公司可能会选择主动注销以避免进一步的法律责任和负面影响。