公司进行股东变更的流程包括以下几个步骤：

1. 股东决议：公司股东通过股东大会或者股东决议书决定进行股东变更，并提出相应的变更方案。

2. 转让协议：原股东和新股东之间需要签订股权转让协议，明确转让的股权比例、转让价格、付款方式等相关条款。

3. 公司备案：公司需要向相关机构进行备案。通常需要提供变更登记申请书、股权转让协议、原股东书面同意等文件。

完成公司股东变更后，需要及时更新相关注册资料，包括公司章程、股东名册、股东会议记录等。