小规模代理记账一般是针对纳税人是小规模纳税人的情况，而一般纳税人代理记账则是适用于纳税人是一般纳税人的情况。小规模纳税人指年销售额不超过500万元的企业，一般纳税人指年销售额超过500万元的企业。

小规模纳税人的纳税申报方式相对较为简单，可以采用月度汇总申报的方式进行。而一般纳税人需要采用增值税专用发票来开票，并且需要进行增值税申报、纳税申报等一系列复杂的税务操作。