公司报税逾期时间较长的，因系统不能办理报税了，需要去现场申请补报，并承担因逾期而产生的后果。同时携带申报相关文件，例如营业执照、财务报表和记录、发票和凭证等资料。根据企业税务逾期的办理情况，准备补报的申请表以及说明书，需要说明税务逾期的具体情形。

公司需要准备好缴纳税款的资金，以及税务机关可能要求的其他文件。完成审核和处理后，税务机关会发放补报税务凭证，确认补报流程结束。