公司变更股东的流程如下：

1、申请人持相关材料向工商部门窗口提出申请，

申请材料经审查员初审通过，开具《受理通知书》；不符合受理条件的，告知申请人应当补正的全部材料。

2、工商部门对申请人申请材料齐全、符合法定形式的，当场作出是否准予登记的决定并出具《登记决定通知书》。

3、申请材料经过工商部门核实后，申请人可以凭《登记决定通知书》到发照窗口换发《准予变更登记通知书》。