企业开出的普通发票，如果在票据流转过程中不慎丢失，企业应当及时向税务机关报告普通发票的丢失情况。税务机关将责令改正，并可能对企业处以罚款，同时也会对企业的纳税信用评价产生影响。

企业对于丢失的普通发票应取得原开票单位的加盖公章的证明，并在证明上注明原凭证号码、金额、内容等信息。该证明经过经办单位的会计机构负责人、会计主管和单位领导的审批后，作为原始凭证入账。