代理注册公司合法的，但需要满足一定条件。根据相关法律规定，设立有限责任公司，应当由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关申请名称预先核准，经批准后，应当由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人申请设立登记。只要不违反法律规定，即可依法登记。