申请食品经营许可需要按照以下流程进行：

1、提交申请：向所在地县级以上地方人民政府食品安全监督管理部门提交书面申请，并按照要求提交相关材料。

2、审核：主管部门对申请材料进行审核，并指派两名以上执法人员进行现场核查。

3、批准：如果申请材料和现场核查均符合法定条件和标准，主管部门将颁发食品经营许可证。

如果申请材料或者现场核查不符合法定条件和标准，主管部门将不予颁发许可证，并书面告知申请人理由。