有限公司需要根据具体情况申报以下主要税种：

1. 增值税：适用于销售货物、提供应税务劳务和委托加工、修理承包等情况。

2. 企业所得税：适用于企业的全年利润，根据法定税率计算应缴税款。

3. 城市维护建设税：按照增值税税率的7%征收。

4. 教育费附加：按照增值税税率的3%征收。

5. 土地使用税：适用于企业使用国有土地时，按照土地使用税法规定计算应缴税款。

6. 印花税：适用于某些特定交易或合同签订时的印花税。