企业在向税务部门提交纳税申报时，可能会遇到以下异常情况：

（1）未按时缴纳所得税、营业税、个人所得税等税费；

（2）存在报表填写错误；

（3）未能按时提交纳税申报表。

对于这些情况，企业需要及时联系当地税务部门进行修改和补充申报。未及时处理这些问题可能会导致企业被罚款，甚至因此被注销营业执照。