企业进行工商年报的流程如下：

1. 登录电子工商年报系统：企业可以在工商行政管理部门指定的电子工商年报系统中登录；

2. 填写年报表格：企业需按照系统要求填写年报表格，包括基本信息、经营情况、财务情况等；

3. 审核报表：填报完成后，系统会对报表进行审核，如有错误或不完整的信息需要修改；

4. 缴纳年报费用：年报审核通过后，企业需要按照规定缴纳年报费用；

5. 提交年报材料：缴费完成后，企业需要将年报表格及相关材料提交至工商行政管理部门。

需要注意的是，企业应该按照规定的时间节点在系统中申报年报，并保证填报的信息真实、准确、完整。否则，可能会被处以罚款等行政处罚。